Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms