Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Lrrtm1Q8K377 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm1Q8K377 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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