Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Abcf3Q8K268 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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