Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms