Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms