Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LgsnQ8CIX8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LgsnQ8CIX8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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LgsnQ8CIX8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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LgsnQ8CIX8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LgsnQ8CIX8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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