Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mterf1aQ8CHZ9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms