Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Snx8Q8CFD4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Snx8Q8CFD4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Snx8Q8CFD4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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