Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms