Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc38Q8CDN8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc38Q8CDN8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc38Q8CDN8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc38Q8CDN8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc38Q8CDN8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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