Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf170Q8CBG9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf170Q8CBG9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf170Q8CBG9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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