Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp20Q8C6M1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp20Q8C6M1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms