Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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ClmnQ8C5W0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ClmnQ8C5W0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClmnQ8C5W0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmnQ8C5W0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmnQ8C5W0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmnQ8C5W0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmnQ8C5W0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmnQ8C5W0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmnQ8C5W0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmnQ8C5W0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClmnQ8C5W0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms