Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp44Q8C2S0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp44Q8C2S0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp44Q8C2S0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp44Q8C2S0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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