Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttc21aQ8C0S4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttc21aQ8C0S4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttc21aQ8C0S4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc21aQ8C0S4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc21aQ8C0S4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21aQ8C0S4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc21aQ8C0S4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms