Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Atg16l1Q8C0J2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg16l1Q8C0J2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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