Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pggt1bQ8BUY9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pggt1bQ8BUY9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pggt1bQ8BUY9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pggt1bQ8BUY9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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