Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Nop53Q8BK35 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop53Q8BK35 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Nop53Q8BK35 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nop53Q8BK35 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nop53Q8BK35 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nop53Q8BK35 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms