Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp1Q8BJQ2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp1Q8BJQ2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms