Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg4dQ8BGV9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg4dQ8BGV9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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