Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Lrrtm2Q8BGA3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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