Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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H2-M10.4Q85ZW8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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