Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrfn4Q80XU8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrfn4Q80XU8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms