Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prpf40bQ80W14 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf40bQ80W14 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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