Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms