Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc1Q80VQ1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc1Q80VQ1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms