Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rexo1Q7TT28 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms