Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccp110Q7TSH4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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