Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vma21Q78T54 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vma21Q78T54 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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