Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms