Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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