Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trak1Q6PD31 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms