Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf2Q6P9P0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms