Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6DFW0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q6DFW0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q6DFW0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms