Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pkp4Q68FH0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkp4Q68FH0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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