Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Surf4Q64310 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms