Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms