Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms