Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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BcanQ61361 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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BcanQ61361 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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BcanQ61361 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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BcanQ61361 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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