Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms