Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atf3Q60765 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms