Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf123Q5XPI3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rnf123Q5XPI3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf123Q5XPI3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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