Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm27Q5SFM8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms