Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Trappc1Q5NCF2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Trappc1Q5NCF2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Trappc1Q5NCF2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Trappc1Q5NCF2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Trappc1Q5NCF2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Trappc1Q5NCF2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Trappc1Q5NCF2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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