Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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