Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shank3Q4ACU6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shank3Q4ACU6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms