Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fam220aQ3ZN08 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms