Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc185Q3V118 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc185Q3V118 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms