Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms