Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9Q3V038 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms